jueves, 30 de octubre de 2014

El final del recorrido




A lo largo del año y de la materia química biológica recorrimos un largo sendero y visitamos varios lugares , cada uno con sus propias características. El siguiente texto es a modo de cierre para este blog y a la vez de resumen para todos aquellos que no nos hayan seguido hasta ahora.
Comenzamos con La casa de las proteínas, donde descubrimos que estas son macromoléculas y que están formadas por ladrillos llamados aminoácidos. Escribimos un texto sobre ellas relacionándolas con la vida diaria que les recomendamos visitar para comprender mejor ciertas cuestiones del tema más complejas.  Posteriormente estudiamos un grupo de proteínas denominadas enzimas, que aceleran las reacciones químicas en la naturaleza, para lo cual subimos un video de la web que explica cómo actúan.
Unas clases más tarde conocimos a otras dos macromoléculas las cuales estaban compuestas cada una por un tipo especial de ladrillo, estas son: hidratos de carbono y lípidos.  Para los hidratos de carbono también subimos un video, y además resolvimos un cuestionario guía. Para estudiar los lípidos realizamos una red conceptual.
También pasamos por Bioenergética donde estudiamos las diversas formas que puede tomar la energía y aprendimos a diferenciar procesos fáciles de difíciles, y cómo estos pueden hacerce fáciles.
En la segunda mitad del año volvimos con  las macromoléculas y nos focalizamos en los ácidos nucleicos, y el ADN y ARN, donde aprendimos como se duplicaba una molécula de ADN, como se copia un gen y cómo este se traduce al “lenguaje” del ARN. En este blog, subimos un video sobre la traducción.
Más adelante comenzamos con un gran tema con el que seguimos a lo largo de todo el resto del cuatrimestre: Metabolismo. Comenzamos con las vías metabólicas, principalmente la glucólisis, y luego realizamos junto a otro grupo un trabajo y exposición sobre la glucogenólisis en una clase de “Química con chocolates”.
Lo último que estudiamos fueron dos vías metabólicas más complejas dentro del proceso de Respiración celular. La primera es el Ciclo de Krebs, para lo cual escribimos un texto que lo explica con tres analogías para comprender mejor ciertas cuestiones complejas y complicadas. La segunda es la Cadena Respiratoria, y realizamos un video casero y manual.
El último lugar que queda por recorrer es de la Fotosíntesis, para ya después terminar este año de química con blogs, creatividad, chocolates y biología.

Somos Barby y Ceci de la Escuela Agropecuaria, y como muchas personas creen que al trabajar en equipo sólo uno hace el trabajo, les mostramos el detrás de escena de esta entrada.

¿No me digan que no les pasan estas cosas cuando trabajan en equipo?





jueves, 16 de octubre de 2014

Cadena Respiratoria

La Cadena Respiratoria es una vía metabólica, que es la principal generadora de ATP en las células en presencia de oxígeno, en la mitocondria. Además reoxida las coenzimas NAD y FAD,  que se redujeron en el Ciclo de Krebs y la glucólisis. En el siguiente video se explica con mayor detalle este proceso.
Comenzamos con el NAD y el FAD reducido...


jueves, 9 de octubre de 2014

Ciclo de Krebs

El ciclo de Krebs es el segundo de los tres procesos que abarca la respiración celular, que ocurren en la mitocondria,con el fin de obtener energía y NAD oxidado (para realizar la glucólisis), el primer proceso es la descarboxilación oxidativa del piruvato, y la última la cadena respiratoria.
Es una vía catabólica (que también puede funcionar como anabólica) cíclica, que transforma el acetil coa en oxalacetato.
Posee tres enzimas reguladoras, que se regulan alostéricamente
  • La Citrato sintasa: la inhibe el ATP (como las tres reacciones generan ATP, si ya hay no es necesaria la reacción)
  • Isocitrato deshidrogenasa: es la principal reguladora. La inhiben el ATP y el NAD reducido, porque la enzima reduce el NAD reducido, para que se pueda oxidar su sustrato y si hay mucha cantidad de NAD reducido, no va a generar más; para entenderlo mejor supongan que llegan a sus casas y se van a preparar la cena (que sería la reacción), pero la pileta está llena de platos sucios que nos incomodan para cocinar (el NAD reducido) , para no generar más platos sucios, debemos eliminar estos lavándolos para poder cocinar.
  • Complejo α-cetoglutanato deshidrogenasa: la inhibe el NAD reducido.

Sus cofactores son el NAD y el FAD oxidados, que al final de la reacción quedan reducidos; es decir que tomaron un protón porque el sustrato necesita ser oxidado (retirarle un protón), y como el protón no puede quedar sólo, es necesario un cofactor que lo capte y se  reduzca. Una posible analogía con esto sería “convertir” al protón de hidrógeno en una pelota de voley, esta no puede quedarse indefinidamente en el aire pero tampoco puede caer al suelo, es por eso que debe irse pasando entre los jugadores. En el caso del ciclo de Krebs los jugadores vendrian a ser el sustrato y el cofactor que reciben la pelota, porque el protón no puede quedar suelto y necesita de alguien que lo capte, así comola pelota necesita ser interceptada.
La vía genera 1 GTP
Su ecuación global es la siguiente:
Acetil Coa + 2H2O + 3NAD oxidado + 1 FAD + GDP ---------> 2CO2 + 3NAD reducido + 1 FAD reducido + 1 GTP

Es una vía termodinámicamente desfavorable (que cuesta realizarla), pero para  facilitar este trabajo  usa su producto todo el tiempo para la primera reacción (ya que es un ciclo) con lo cual la reacción tiene que estar  permanentemente formando el oxalacetato (hasta cubrir los requerimientos de la célula) y el proceso se vuelve espontáneo. Si les cuesta entenderlo piénselo de esta manera: Supongamos que estamos haciendo un examen de Física, y hay un problema cuyo enunciado se ve muy complicado y no tenemos ganas de hacerlo (este problema representaría al ciclo, que cuesta realizarlo), pero mientras seguimos leyendo la prueba nos damos cuenta de que para resolver los siguientes ejercicios necesitamos el resultado del primero (el resultado representa al oxalacetato necesario para la primera reacción), entonces, a pesar de que no queramos resolver ese punto, el hecho de que lo necesitemos para los demás problemas nos incita a resolverlo.

jueves, 2 de octubre de 2014

Química con chocolate

La glucosa es la principal fuente de energía de nuestro organismo (así como de todos los seres vivos), por ese motivo es muy importante ingerir en nuestra dieta alimentos con elevado contenido de glucosa, como el chocolate.
quimica con chocolate.jpg
Para comprender las vías metabólicas en las que participaba la glucosa (como sustrato, producto, etc) se realizó una clase especial en la que, por grupos, se hacían exposiciones orales sobre las distintas vías, estas eran la Glucogenólisis, la Gluconeogénesis, la Vía de las Pentosas Fosfato y la Glucógenogénesis. Pero, además, hicimos una clase de “Química con chocolate” en la que todos comíamos chocolate antes y durante nuestras presentaciones para obtener energía y estar más preparados para los orales; mientras comíamos analizábamos el “recorrido” que seguía la glucosa en nuestro organismo y las distintas vías en las que participaba, que iban coicidiendo que la vía metabólica a exponer en el momento.

Las integrantes de este blog, junto con los integrantes del blog http://quimicabienlogicade4to.blogspot.com.ar/  realizamos una presentación sobre la vía metabólica de la entrada anterior, la Glucogenólisis, con un Power Point.
quimica con chocolate 2.jpg

miércoles, 24 de septiembre de 2014

Glucogenólisis

La glucogenólisis es la vía por la cual se degrada glucógeno para la obtención de glucosa de una forma rápida. Más específicamente del glucógeno se obtiene glucosa-1-fosfato. Es una vía catabólica que convierte una molécula compleja en una más simple. Estas vías son exergónicas y oxidativas. Tiene como objetivo obtener glucosa durante períodos de hipoglucemia e hipoxia recurriendo a la reserva de glucógeno.
La glucogenólisis consta de 4 etapas : 1) Fosforólisis del glucógeno, 2) Hidrólisis de uniones glucosídicas alfa 1-6, 3) Formación de la glucosa-6-fosfato y 4) Formación de la glucosa libre. Estas etapas ocurren en las células del hígado y del músculo, la diferencia es que, en el músculo,  la glucosa-6-fosfato formada (etapa 3) no puede hidrolizarse (etapa 4) debido a la ausencia de la enzima glucosa-6-fosfatasa (que se encuentra en las membranas del retículo endoplasmático del hígado, intestino y riñón) y sigue su camino catabólico en el propio músculo, principalmente por vía de la glucólisis. Esto explica por qué el hígado, riñón e intestino pueden ceder glucosa a la circulación y el músculo no. A nivel celular, está vía ocurre en el citosol.
En el hígado cumple una función importante como regulador de glucemia, asegurando la provisión constante de glucosa a todos los tejidos. En el músculo, el glucógeno actúa como reserva rápidamente movilizable que provee combustible para la contracción.
Si bien la glucogenólisis es una vía catabólica, esta no produce ATP. Como se ve en la figura que representa la reacción, la vía consume un fosfato que luego libera, es decir que no hay gasto de ATP, ya que este fosfato puede provenir del medio no siendo necesaria la hidrólisis de ATP. Por lo tanto el balance energético de la glucogenólisis  es cero.




El sustrato es el glucógeno, que es degradado dando como orígen, la glucosa.
La regulación se da por la enzima glucógeno fosforilasa  que responde a efectos alostéricos y a modificaciones covalentes. Ésta posee una coenzima denominada Piridoxal fosfato.
Ésta enzima está activada cuando está fosfocilada (es decir, cuando tiene un fosfaro)La fosforilasa es activada por el glucagón (en el hígado) y la epinefrina (en el músculo) y desactivada por insulina.


El factor limitante de esta vía metabólica es la presencia de fosfato (ya sea en forma de ATP o de fosfato inorgánico), porque la fosforilasa no puede iniciar la reacción de la glucogenólisis.

sábado, 13 de septiembre de 2014

Metabolismo: La glucogenólisis

Para empezar con ésta nueva unidad de Metabolismo, aquí tenemos un breve texto que describe una de las vías metabólicas mas importantes: La Glucogenólisis

La glucogenólisis es la vía por la cual se degrada glucógeno para la obtención de glucosa de una forma rápida. Más específicamente del glucógeno se obtiene glucosa-1-fosfato. Es una vía catabólica que convierte una molécula compleja en una más simple. Estas vías liberan ATP, son exergónicas y oxidativas. Tiene como objetivo obtener glucosa durante períodos de hipoglucemia e hipoxia recurriendo a la reserva de glucógeno.
La glucogenólisis consta de 4 etapas, y ocurre en las células del hígado, en el músculo ocurren sólo las tres primeras, y en el riñón y el intestino, la última (ésto explica por qué el hígado, el riñón y el intestino pueden ceder glucosa a la circulación y el músculo no). A nivel celular, está vía ocurre en las membranas del retículo endoplasmático)
En el hígado cumple una función importante como regulador de glucemia, asegurando la provisión constante de glucosa a todos los tejidos. En el músculo, el glucógeno actúa como reserva rápidamente movilizable que provee combustible para la contracción.
El balance energético de esta vía metabólica es de -4, ya que con el paso de Glucosa-6-fosfato a glucosa se utiliza ATP, la cual no vuelve a recuperarse.


El sustrato es el glucógeno, que es degradado dando como orígen, la glucosa.
La regulación se da por la enzima glucógeno fosforilasa  que responde a efectos alostéricos y a modificaciones covalentes. Ésta posee una coenzima denominada Piridoxal fosfato.
La fosforilasa es activada por adrenalina y glucagón y desactivada por insulina. Ésta enzima está activada cuando está fosfocilada (es decir, cuando tiene un fosfaro)
Poniendo en palabras técnicas y más ordenado lo que mencionamos recién:
1. Disminución de los niveles de n de los niveles de cAMP.
  • Inactivación de la adenilato ciclasa por separación de G-GTP a  G-GDP y su separación de la enzima
  • Hidrólisis del cAMP por la fosfodiesterasa
  • Inactivación de la Proteína quinasa A
2. Disminución del Ca2+ intracelular por bombeo a los correspondientes reservorios
3. Defosforilización de la glucógeno geno fosforilasa y la y la fosforilasa
quinasa por una fosfoproteín-fosfatasa que se inactiva por
efecto del glucagón y proteína quinasas

El factor limitante de esta vía metabólica es la presencia de fosfato (ya sea en forma de ATP o de fosfato inorgánico), porque la fosforilasa no puede iniciar la reacción de la glucogenólisis.

jueves, 14 de agosto de 2014

Ácidos nucleicos: Traducción.




Preguntas:
¿Cómo inicia el proceso de traducción?
¿En que consiste en proceso de traducción?
¿Qué sucede una vez finaliza el proceso?